Hideki Motosuwa, ein 18-jähriger Junge aus Hokkaido, macht sich auf den Weg nach Tokio. Dort angekommen trifft er zunächst auf seine Vermieterin Chitose Hibiya und seinen neuen Nachbarn Hiromu Shinbo, der außerdem auch noch sein zukünftiger Klassenkamerad am Förderinstitut sein wird. Als er später am Abend vom Einkaufen zurückkommt findet Hideki einen Persocom im Müll und nimmt ihn sofort mit nach Hause. Nach einigen Fehlversuchen schafft er es auch ihn zu aktivieren. Chii ist erwacht.

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Shinbo findet Chii in Hidekis Zimmer und merkt auch sofort, dass dieser absolut keine Ahnung von Technik hat. Zusammen mit seinem eigenen Persocom Sumomo versucht Shinbo Hideki zu helfen. Mit Sumomo finden sie heraus, dass Chii über keine Festplatte verfügt und das ihr CPU zu hoch für Sumomo ist, sodass sie abstürzt. Shinbo vereinbart für Hideki ein Treffen mit seinem Freund Minoru, ein Persocomspezialist. Aber auch seine selbstgebauten Persocoms stürzen ab und so erzählt er Hideki vom Chobit Mythos. Zu guter letzt gibt er Hideki noch einen gut gemeinten Rat: Verliebe dich niemals in einen Persocom...

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Hideki besucht zum ersten Mal das Seki-Förderinstitut aber muss auch feststellen, dass er total pleite ist. Er beschließt also sich einen Teilzeitjob zu suchen und obwohl Chii mittlerweile gelernt hat Hideki zu verabschieden wird er sehr bald feststellen, dass Sprache sehr viele Möglichkeiten für Missverständnisse offen lässt. Nach einigen Versuchen gelingt es Hideki einen Job im Gasthaus "Zum Glückspilz" zu finden, wo er auch Yumi Omura kennenlernt, die ihm auch sogleich den Kopf verdreht.

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Hideki fällt auf das Chii Kleidung fehlt und ausgerechnet auch noch Unterwäsche. Nur leider ist es ihm viel zu peinlich selber welche kaufen zu gehen. Weiter als vor so einen Laden hat er es wohl nie geschafft. Shinbo aber leiht Chii Sumomo als Navigationsgerät und so ziehen die beiden Persocoms los um Unterwäsche zu kaufen. Chii ist also zum ersten Mal alleine unterwegs, was Hideki natürlich auch die ganze Zeit beschäftigt. Nach einigen Schwierigkeiten aber gelingt es Chii mit gekaufter Unterwäsche nach Hause zu kommen. Nur zu dumm, dass es sich dabei um Männerunterwäsche handelt. Hideki wird wohl doch nochmal versuchen müssen den Unterwäscheladen zu betreten und nicht wieder schreiend davon zu laufen.

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Hideki hat durch seinen Job kaum noch Zeit für die Schule, und das obwohl eine wichtige Prüfung ansteht. Er nimmt also einen Tag frei, um zu lernen. Nur zu dumm, dass ihm da einfällt, dass er sein Englisch Lexikon zu Hause vergessen hat. So zieht er los mit Chii zur nächsten Buchhandlung. Chii ist auf einmal fasziniert von einen Buch mit dem Titel "Die menschenleere Stadt". Anstatt sich von seinem letzten Geld das Lexion zu kaufen, besorgt Hideki das Bilderbuch für Chii. Zum Glück macht ihm Shinbo das Angebt ihm sein Lexikon auszuleihen. Aber irgendwas scheint mit Chii nicht zu stimmen...

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Hideki kann seine Stromrechnungen nicht mehr bezahlen, was aber nicht sein größtes Problem ist. Chii scheint es immer schlechter zu gehen. Sein Freund Shinbo erinnert ihn daran, dass die Batterien eines Persocoms von Zeit zu Zeit aufgeladen werden müssen. Ohne Strom und Telefon hat Hideki jetzt also ein großes Problem, besonders da es Chii nicht gerade besser geht. Er muss also schnellstens eine andere Stromquelle finden...

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Die Geldsorgen wollen einfach kein Ende nehmen und so langsam merkt auch Chii, dass Hideki sich große Sorgen macht. Er erklärt ihr, wofür man Geld braucht und wie man es bekommt. Chii beschließt daraufhin sich einen Job zu suchen. Auch Yumi bemerkt Hidekis Sorgen und lädt ihn zum Essen ein. Das Angebot lehnt Hideki nicht ab, aber Chii hat derweil andere Probleme. Sie hat zwar einen Job gefunden aber ausgerechnet als Stripperin in einer Peepshow. Doch bevor sie diesen Fehler begeht, wird sie von einer inneren Stimme davor gewarnt. Wird Hideki noch rechtzeitig kommen?

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Chii ist spurlos verschwunden. Hideki versucht sie mit Hilfe vom Sumomo zu finden aber plötzlich reagieren alle Persocoms nicht mehr auf die Befehle ihrer Besitzer darunter auch Sumomo und Yuzuki. Zum Glück findet Hideki Chii auf einem Laternenmast und kann sie sicher nach Hause bringen. Er verspricht ihr einen Job zu besorgen. Den findet er auch in einer Konditorei. Chii bekommt also ihren ersten Gehaltsscheck und lernt außerdem noch etwas über Zuneigung.

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Chii bekommt ihr erstes selbstverdientes Geld und beschließt davon ein Geschenk für Hideki zu kaufen. Hideki ist währenddessen mit Shinbo im öffentlichen Bad und lernt dabei von Shinbo, dass auch Persocoms ab und an baden müssen. Das Hideki es ohne Unterstützung nicht schaffen wird Chii das Baden beizubringen dürfte klar sein aber was ist mit dem Foto, dass Minoru ihm zeigt? Es scheint ein Bild von Chii zu sein oder nicht?

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When it comes to dating, Hideki's clueless. While on a date with his coworker Yumi, he's stumped by her heavy questions concerning Persecoms. Alone at home, Chi gets wrapped up in another book that seems to touch her in a deep, hidden place.

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Paranoia takes hold of Hideki when he hears a murder story and is convinced the apartment below his is haunted. Ms. Hibiya, Shinbo, and Minoru join forces to investigate the building and dispel Hideki's fears before he loses too much sleep.

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After his boss gives him a DVD player, Hideki gets a video game from Minoru. Overjoyed to know Chi can play games too, Hideki hooks her and Sumomo up to the TV to give it a try, but things never seem to go as expected with Chi.

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Hideki's got the bad grade blues, but a trip to Minoru's beach house is too tempting to turn down. When curiosity gets Chi and Hideki into deep water, an unexpected rescue surprises everyone.

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A tipsy Ms. Shimizu shows up at Hideki's apartment for a personal pop quiz. At school the next day, Shinbo doesn't act like himself either.

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With no warning, Shinbo disappears, leaving Sumomo under Hideki's care. When Hideki gets to school he realizes Ms. Shimizu is gone, too! When Shinbo finally calls he better have a good explanation.

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Hideki takes a week off from work to study for a big test. But when he loses his wallet, growls from his empty stomach ruin all hopes of concentration. Determined to help her master, Chi goes on a mission to cure his hunger pangs.

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While helping Ms. Hibiya with routine cleaning around the apartments, Hideki learns some unexpected facts about his landlady's past experience with Persecoms.

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Yumi makes a comment that leaves Hideki pondering his relationship with Chi. His true feelings show as he jumps into action when Chi doesn't make it home from work at Tiroll.

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While Hideki, Minoru, and Ueda (Chi's manager at Tiroll) frantically scour the entire city for poor Chi, Ueda shares a personal story about the Persecom dear to him.

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Anxious to analyze her, Chi's abductor, who goes by Dragonfly on the web, connects her to a room full of his custom models. As he trespasses on forbidden territory, Chi's dark side gets physical to disable his attempts.

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Chi is home safe, but Hideki notes something new between them. Minoru continues his relentless search for more information on the mysterious Chobits. Despite Hideki's violent contempt, Dragonfly eagerly - and apologetically - offers his help.

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When Chi tries on what she thinks is a new uniform at Tiroll, she learns even more about how people show their feelings for each other - and decides who her special someone is.

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Chi's tragic past is finally revealed, and Hideki realizes now more than ever just how extraordinary the little supercomputer really is.

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With the utterance of his true feelings for Chi, Hideki unknowingly triggers a special program so powerful it will affect the future of all Persecoms and their owners.

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Sumomo's hard drive is almost full, so Shinbo reviews all the memories his portable Persecom has collected of their fun and adventures with Hideki and Chi!

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Minoru and Yuzuki continue their diligent search for clues to Chi's origins and reliable information about the legendary Chobits. They recall what they've observed since Hideki brought Chi to Minoru's mansion for any hints.

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Ms. Hibiya is preparing a special dinner for Hideki and his friends. With only Kotoko around, she reminisces aloud the events leading up to how Chi discovered true happiness.

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